Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf172C9J069 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf172C9J069 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms