Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00587B1AMM8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms