Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf170A2RU37 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms