Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN4Q9Y3Q4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN4Q9Y3Q4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms