Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms