Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP11Q9Y3A2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms