Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCE1Q9Y256 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms