Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC42.38■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC42.38■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CCDC180Q9P1Z9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCDC180Q9P1Z9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms