Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms