Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD3Q9NYL9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD3Q9NYL9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
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