Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM53CQ9NYF3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM53CQ9NYF3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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