Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXL12Q9NXK8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms