Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT1Q9NXH9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms