Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.988e-10■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.058e-10■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.18e-10■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 CNKSR3-202ENST00000433165 2347 ntTSL 1 (best)7.37□□□□□ -1.233e-14■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 KDM3A-210ENST00000470160 2955 ntTSL 27.14□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.293e-14■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 ELP2-222ENST00000543127 535 ntTSL 45.5□□□□□ -1.533e-14■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.558e-10■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 KDM3A-214ENST00000491383 4485 ntTSL 1 (best)5.15□□□□□ -1.581e-6■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 KIAA1217-215ENST00000635163 1358 ntTSL 54.37□□□□□ -1.718e-10■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 IBTK-203ENST00000445419 3663 ntTSL 24.3□□□□□ -1.728e-10■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.868e-10■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 IBTK-207ENST00000505222 5547 ntTSL 1 (best)2.8□□□□□ -1.968e-10■■■■■ 28.5
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RBM22Q9NW64 ATG9A-217ENST00000456708 576 ntTSL 417.84■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 28.5
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RBM22Q9NW64 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 28.5
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RBM22Q9NW64 ATG9A-203ENST00000409033 3701 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 54.88□□□□□ -1.636e-8■■■■■ 28.5
RBM22Q9NW64 MLLT10-206ENST00000420525 538 ntTSL 31.27□□□□□ -2.216e-8■■■■■ 28.5
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RBM22Q9NW64 GATAD2A-208ENST00000444839 565 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 28.4
RBM22Q9NW64 GATAD2A-206ENST00000429242 504 ntTSL 311.35□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 28.4
RBM22Q9NW64 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 28.4
RBM22Q9NW64 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 28.4
RBM22Q9NW64 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 28.4
RBM22Q9NW64 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 312.05□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 28.4
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RBM22Q9NW64 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-10■■■■■ 28.4
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RBM22Q9NW64 LIN9-204ENST00000460719 2909 ntTSL 1 (best)3.64□□□□□ -1.833e-10■■■■■ 28.4
RBM22Q9NW64 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)24.05■■□□□ 1.443e-17■■■■■ 28.4
RBM22Q9NW64 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.863e-17■■■■■ 28.4
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RBM22Q9NW64 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.723e-17■■■■■ 28.4
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RBM22Q9NW64 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 39.04□□□□□ -0.963e-17■■■■■ 28.4
RBM22Q9NW64 DDX46-209ENST00000509255 398 ntTSL 21.3□□□□□ -2.22e-14■■■■■ 28.4
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RBM22Q9NW64 WDR59-215ENST00000568462 550 ntTSL 44.51□□□□□ -1.695e-11■■■■■ 28.4
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RBM22Q9NW64 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 28.2
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RBM22Q9NW64 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.437e-7■■■■■ 28.2
RBM22Q9NW64 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.956e-6■■■■■ 28.2
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RBM22Q9NW64 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.86e-6■■■■■ 28.2
RBM22Q9NW64 PABPC4-221ENST00000525751 556 ntTSL 48.34□□□□□ -1.077e-8■■■■■ 28.1
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RBM22Q9NW64 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPR-207ENST00000470941 560 ntTSL 46.68□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPR-205ENST00000463552 837 ntTSL 46.08□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 HNRNPR-208ENST00000476451 814 ntTSL 45.96□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DGCR8-210ENST00000498171 3661 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.941e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DENR-204ENST00000539463 671 ntTSL 225.92■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CANX-212ENST00000506654 592 ntTSL 323.06■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CANX-208ENST00000504579 533 ntTSL 423.06■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 PRRC2B-205ENST00000451855 1762 ntTSL 521.99■■□□□ 1.117e-7■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 SRRM1-206ENST00000466910 799 ntTSL 219.26■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)18.68■□□□□ 0.583e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DUS1L-204ENST00000542088 1040 ntTSL 317.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 DUS1L-203ENST00000538833 1250 ntTSL 1 (best)17.65■□□□□ 0.425e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 28.1
RBM22Q9NW64 CANX-204ENST00000502498 570 ntTSL 417.55■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 28.1
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