Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARVAQ9NVD7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms