Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
INTS9Q9NV88 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms