Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPRMQ9NS64 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms