Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms