Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP2-4Q9BYR9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms