Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AGMATQ9BSE5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AGMATQ9BSE5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms