Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP1Q99653 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms