Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPALINQ96PE5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms