Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCZQ96LD1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCZQ96LD1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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