Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIM44Q96DX7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM44Q96DX7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms