Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCC1Q96CN9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCC1Q96CN9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms