Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAM3DQ96BQ1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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