Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC12Q8WUD4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms