Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPAS3Q8IXF0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS3Q8IXF0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms