Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUFY3Q7L099 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUFY3Q7L099 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms