Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf89Q6UWU4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf89Q6UWU4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms