Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF7Q6Q0C0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF7Q6Q0C0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms