Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM4Q6P4Q7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM4Q6P4Q7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms