Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRAGBQ5VZM2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms