Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM29Q5VYK3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM29Q5VYK3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms