Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC30Q5VVM6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC30Q5VVM6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms