Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1BQ5VTD9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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