Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC01545Q5VT33 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms