Protein–RNA interactions for Protein: Q5T8R8

C9orf66, Uncharacterized protein C9orf66, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf66Q5T8R8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf66Q5T8R8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf66Q5T8R8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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