Protein–RNA interactions for Protein: Q3E811

RRT15, Regulator of rDNA transcription protein 15, yeastyeast

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT15Q3E811 YPL039WYPL039W 951 nt0.8□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 SPO77YLR341W 1434 nt0.8□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 YJR061WYJR061W 2808 nt0.79□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 snR68snR68 136 nt0.79□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 YGL118CYGL118C 438 nt0.79□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 YJL119CYJL119C 324 nt0.79□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.79□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 MSN5YDR335W 3675 nt0.78□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 SCC2YDR180W 4482 nt0.78□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 YGR130CYGR130C 2451 nt0.78□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 NCA2YPR155C 1851 nt0.78□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 YER121WYER121W 345 nt0.78□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.78□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.78□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 CTL1YMR180C 963 nt0.78□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 TBS1YBR150C 3285 nt0.78□□□□□ -2.28
RRT15Q3E811 UBP11YKR098C 2154 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YLR149CYLR149C 2193 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 CDC53YDL132W 2448 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 VAM6YDL077C 3150 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YNL114CYNL114C 372 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YOL162WYOL162W 648 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 SPE1YKL184W 1401 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 MUM3YOR298W 1440 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 MSS11YMR164C 2277 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 SIP4YJL089W 2490 nt0.77□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 MAD1YGL086W 2250 nt0.76□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 CDC50YCR094W 1176 nt0.76□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 COBQ0105 1158 nt0.76□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 RTT102YGR275W 474 nt0.76□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 CIC1YHR052W 1131 nt0.76□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 RPL34BYIL052C 366 nt0.76□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 CTF18YMR078C 2226 nt0.76□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 MSH5YDL154W 2706 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 ASM4YDL088C 1587 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YDL062WYDL062W 426 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 AIM6YDL237W 1173 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 HOP2YGL033W 657 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 UPF3YGR072W 1164 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YHL044WYHL044W 708 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YML003WYML003W 873 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 CSI2YOL007C 1026 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 EAF1YDR359C 2949 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 NST1YNL091W 3723 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 MDS3YGL197W 4464 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 MSH3YCR092C 3057 nt0.75□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YDR336WYDR336W 945 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 MTC7YEL033W 420 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YFR056CYFR056C 369 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YIL161WYIL161W 708 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 CTK2YJL006C 972 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 SNC1YAL030W 354 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 RPS18BYML026C 441 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 HCH1YNL281W 462 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 GRE2YOL151W 1029 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 FIG1YBR040W 897 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 AZF1YOR113W 2745 nt0.74□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 MAK10YEL053C 2202 nt0.73□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 RMD5YDR255C 1266 nt0.73□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 MER1YNL210W 813 nt0.73□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.72□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 SHE9YDR393W 1371 nt0.72□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 LCL2YLR104W 396 nt0.72□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 CUR1YPR158W 759 nt0.72□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 SRB4YER022W 2064 nt0.72□□□□□ -2.29
RRT15Q3E811 BEM2YER155C 6504 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 FUS2YMR232W 2034 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 PCL2YDL127W 927 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 SNO3YFL060C 669 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 RPS25AYGR027C 327 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 BUD19YJL188C 309 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 SNO2YNL334C 669 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 SMC4YLR086W 4257 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 SEC3YER008C 4011 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 MUK1YPL070W 1839 nt0.71□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 SPO75YLL005C 2607 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 IRE1YHR079C 3348 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 VOA1YGR106C 798 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 MSL1YIR009W 336 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 ARG3YJL088W 1017 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 YPR063CYPR063C 423 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 MRPL27YBR282W 441 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 ZRG17YNR039C 1818 nt0.7□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 DSE1YER124C 1722 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 DCP2YNL118C 2913 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 CMC2YBL059C-A 330 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 NOP15YNL110C 663 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 ERP4YOR016C 624 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 SRL4YPL033C 846 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 CTF13YMR094W 1437 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 YDR338CYDR338C 2088 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 ASI3YNL008C 2031 nt0.69□□□□□ -2.3
RRT15Q3E811 BPH1YCR032W 6504 nt0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms