Protein–RNA interactions for Protein: Q3E811

RRT15, Regulator of rDNA transcription protein 15, yeastyeast

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT15Q3E811 NSR1YGR159C 1245 nt14.29□□□□□ -0.12
RRT15Q3E811 YML009W-BYML009W-B 477 nt14.22□□□□□ -0.13
RRT15Q3E811 NOP1YDL014W 984 nt13.84□□□□□ -0.19
RRT15Q3E811 YKL036CYKL036C 393 nt12.72□□□□□ -0.37
RRT15Q3E811 MDJ1YFL016C 1536 nt12.67□□□□□ -0.38
RRT15Q3E811 Q0297Q0297 156 nt12.15□□□□□ -0.46
RRT15Q3E811 SRX1YKL086W 384 nt12.13□□□□□ -0.47
RRT15Q3E811 YJL027CYJL027C 417 nt11.82□□□□□ -0.52
RRT15Q3E811 SCS3YGL126W 1143 nt11.53□□□□□ -0.56
RRT15Q3E811 YCR051WYCR051W 669 nt11.42□□□□□ -0.58
RRT15Q3E811 DBP2YNL112W 1641 nt11.27□□□□□ -0.61
RRT15Q3E811 YOL085CYOL085C 342 nt11.04□□□□□ -0.64
RRT15Q3E811 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT15Q3E811 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT15Q3E811 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT15Q3E811 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT15Q3E811 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT15Q3E811 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT15Q3E811 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT15Q3E811 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT15Q3E811 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT15Q3E811 SSA3YBL075C 1950 nt10.89□□□□□ -0.67
RRT15Q3E811 RPP1BYDL130W 321 nt10.88□□□□□ -0.67
RRT15Q3E811 YBR190WYBR190W 312 nt10.88□□□□□ -0.67
RRT15Q3E811 PKP1YIL042C 1185 nt10.81□□□□□ -0.68
RRT15Q3E811 CCC1YLR220W 969 nt10.8□□□□□ -0.68
RRT15Q3E811 RTC3YHR087W 336 nt10.54□□□□□ -0.72
RRT15Q3E811 RVS167YDR388W 1449 nt10.5□□□□□ -0.73
RRT15Q3E811 SCJ1YMR214W 1134 nt10.47□□□□□ -0.73
RRT15Q3E811 PET122YER153C 765 nt10.38□□□□□ -0.75
RRT15Q3E811 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.38□□□□□ -0.75
RRT15Q3E811 ATS1YAL020C 1002 nt10.32□□□□□ -0.76
RRT15Q3E811 SCR1SCR1 522 nt10.22□□□□□ -0.77
RRT15Q3E811 SHR5YOL110W 714 nt10.16□□□□□ -0.78
RRT15Q3E811 RRN5YLR141W 1092 nt10.07□□□□□ -0.8
RRT15Q3E811 YDJ1YNL064C 1230 nt10.07□□□□□ -0.8
RRT15Q3E811 PUT4YOR348C 1884 nt9.95□□□□□ -0.82
RRT15Q3E811 URN1YPR152C 1398 nt9.89□□□□□ -0.83
RRT15Q3E811 YER088W-BYER088W-B 147 nt9.88□□□□□ -0.83
RRT15Q3E811 DEP1YAL013W 1218 nt9.82□□□□□ -0.84
RRT15Q3E811 OPI9YLR338W 858 nt9.8□□□□□ -0.84
RRT15Q3E811 RSB1YOR049C 1065 nt9.8□□□□□ -0.84
RRT15Q3E811 GAR1YHR089C 618 nt9.78□□□□□ -0.84
RRT15Q3E811 ARE1YCR048W 1833 nt9.74□□□□□ -0.85
RRT15Q3E811 RPN10YHR200W 807 nt9.73□□□□□ -0.85
RRT15Q3E811 YNL208WYNL208W 600 nt9.73□□□□□ -0.85
RRT15Q3E811 SAH1YER043C 1350 nt9.72□□□□□ -0.85
RRT15Q3E811 PST2YDR032C 597 nt9.6□□□□□ -0.87
RRT15Q3E811 POA1YBR022W 534 nt9.58□□□□□ -0.88
RRT15Q3E811 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.56□□□□□ -0.88
RRT15Q3E811 PUN1YLR414C 792 nt9.5□□□□□ -0.89
RRT15Q3E811 TIR1YER011W 765 nt9.49□□□□□ -0.89
RRT15Q3E811 YJR018WYJR018W 363 nt9.44□□□□□ -0.9
RRT15Q3E811 SSA1YAL005C 1929 nt9.4□□□□□ -0.9
RRT15Q3E811 BSC6YOL137W 1494 nt9.4□□□□□ -0.91
RRT15Q3E811 NVJ2YPR091C 2313 nt9.38□□□□□ -0.91
RRT15Q3E811 PTC2YER089C 1395 nt9.37□□□□□ -0.91
RRT15Q3E811 YJR120WYJR120W 351 nt9.34□□□□□ -0.91
RRT15Q3E811 FPS1YLL043W 2010 nt9.33□□□□□ -0.92
RRT15Q3E811 BUD23YCR047C 828 nt9.29□□□□□ -0.92
RRT15Q3E811 NAB2YGL122C 1578 nt9.29□□□□□ -0.92
RRT15Q3E811 PAC11YDR488C 1602 nt9.28□□□□□ -0.92
RRT15Q3E811 SRB2YHR041C 633 nt9.25□□□□□ -0.93
RRT15Q3E811 RPP2BYDR382W 333 nt9.2□□□□□ -0.94
RRT15Q3E811 SHU1YHL006C 453 nt9.19□□□□□ -0.94
RRT15Q3E811 FIS1YIL065C 468 nt9.16□□□□□ -0.94
RRT15Q3E811 DAL1YIR027C 1383 nt9.14□□□□□ -0.95
RRT15Q3E811 INM2YDR287W 879 nt9.14□□□□□ -0.95
RRT15Q3E811 SPT5YML010W 3192 nt9.14□□□□□ -0.95
RRT15Q3E811 YKL097CYKL097C 411 nt9.12□□□□□ -0.95
RRT15Q3E811 SSA4YER103W 1929 nt9.06□□□□□ -0.96
RRT15Q3E811 BDH2YAL061W 1254 nt9.06□□□□□ -0.96
RRT15Q3E811 WWM1YFL010C 636 nt9.05□□□□□ -0.96
RRT15Q3E811 PHO4YFR034C 939 nt9.05□□□□□ -0.96
RRT15Q3E811 FPR4YLR449W 1179 nt9.03□□□□□ -0.96
RRT15Q3E811 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.01□□□□□ -0.97
RRT15Q3E811 YBL100CYBL100C 315 nt9□□□□□ -0.97
RRT15Q3E811 YGR021WYGR021W 873 nt8.99□□□□□ -0.97
RRT15Q3E811 HOM6YJR139C 1080 nt8.98□□□□□ -0.97
RRT15Q3E811 LSM3YLR438C-A 270 nt8.95□□□□□ -0.98
RRT15Q3E811 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt8.93□□□□□ -0.98
RRT15Q3E811 YPS1YLR120C 1710 nt8.93□□□□□ -0.98
RRT15Q3E811 BDF1YLR399C 2061 nt8.92□□□□□ -0.98
RRT15Q3E811 FUN26YAL022C 1554 nt8.91□□□□□ -0.98
RRT15Q3E811 YDR095CYDR095C 411 nt8.87□□□□□ -0.99
RRT15Q3E811 MNP1YGL068W 585 nt8.87□□□□□ -0.99
RRT15Q3E811 TRM9YML014W 840 nt8.87□□□□□ -0.99
RRT15Q3E811 MEP2YNL142W 1500 nt8.85□□□□□ -0.99
RRT15Q3E811 RKM5YLR137W 1104 nt8.83□□□□□ -1
RRT15Q3E811 CCT6YDR188W 1641 nt8.83□□□□□ -1
RRT15Q3E811 YOR139CYOR139C 393 nt8.8□□□□□ -1
RRT15Q3E811 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt8.76□□□□□ -1.01
RRT15Q3E811 TAT1YBR069C 1860 nt8.76□□□□□ -1.01
RRT15Q3E811 ALF1YNL148C 765 nt8.75□□□□□ -1.01
RRT15Q3E811 YOL037CYOL037C 354 nt8.74□□□□□ -1.01
RRT15Q3E811 SUF2tP(AGG)C 72 nt8.72□□□□□ -1.01
RRT15Q3E811 SUF10tP(AGG)N 72 nt8.72□□□□□ -1.01
RRT15Q3E811 SIS1YNL007C 1059 nt8.72□□□□□ -1.01
RRT15Q3E811 PTP1YDL230W 1008 nt8.7□□□□□ -1.02
RRT15Q3E811 NPL3YDR432W 1245 nt8.69□□□□□ -1.02
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