Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPROQ16827 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPROQ16827 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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