Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
VPS72Q15906 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
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