Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA2Q15822 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms