Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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HERC1Q15751 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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HERC1Q15751 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HERC1Q15751 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HERC1Q15751 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HERC1Q15751 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERC1Q15751 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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HERC1Q15751 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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HERC1Q15751 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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HERC1Q15751 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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HERC1Q15751 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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HERC1Q15751 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
HERC1Q15751 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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