Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAM1Q15629 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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