Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 AP1G2-228ENST00000556966 1098 ntTSL 310.44□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 B3GNTL1-206ENST00000571954 881 ntTSL 512.73□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 AMBP-204ENST00000603230 1057 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.185e-8■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 AMBP-203ENST00000540645 1356 ntTSL 211.44□□□□□ -0.585e-8■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 CTSA-212ENST00000606394 584 ntTSL 412.3□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 ATXN2L-206ENST00000561539 509 ntTSL 34.54□□□□□ -1.686e-21■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.015e-8■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.947e-8■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 TEAD1-202ENST00000525312 1134 ntTSL 1 (best)11.34□□□□□ -0.597e-8■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.797e-8■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.257e-8■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.257e-8■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 HNRNPH1-238ENST00000521116 806 ntTSL 419.17■□□□□ 0.662e-18■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 HNRNPH1-212ENST00000505087 592 ntTSL 316.01■□□□□ 0.152e-18■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 HNRNPH1-225ENST00000515158 850 ntTSL 414.34□□□□□ -0.112e-18■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 HNRNPH1-220ENST00000513225 805 ntTSL 412.81□□□□□ -0.362e-18■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 HNRNPH1-209ENST00000504348 594 ntTSL 412.27□□□□□ -0.452e-18■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 HNRNPH1-234ENST00000519707 582 ntTSL 211.97□□□□□ -0.492e-18■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 HNRNPH1-233ENST00000519455 451 ntTSL 411.95□□□□□ -0.52e-18■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 HNRNPH1-222ENST00000513972 761 ntTSL 211.5□□□□□ -0.572e-18■■■■■ 36.4
SF3B4Q15427 KDM5A-210ENST00000544760 2338 ntTSL 220.56■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 BUD23-215ENST00000471215 3886 ntTSL 29.24□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 FASN-203ENST00000579410 424 ntTSL 29.51□□□□□ -0.892e-14■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 UQCC1-217ENST00000482440 306 ntTSL 315.06■□□□□ 08e-23■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 CARM1-206ENST00000588947 468 ntTSL 527.54■■■□□ 21e-19■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 CARM1-207ENST00000589693 601 ntTSL 510.1□□□□□ -0.791e-19■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 CARM1-208ENST00000590039 596 ntTSL 510.04□□□□□ -0.81e-19■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.372e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.352e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-211ENST00000466143 1681 ntTSL 512.38□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-217ENST00000491688 626 ntTSL 210.69□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-213ENST00000469877 1501 ntTSL 210.68□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.972e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 RBM3-201ENST00000354480 1884 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.639e-28■■■■■ 36.3
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SF3B4Q15427 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 YBX3-207ENST00000539204 649 ntTSL 311.12□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 YBX3-208ENST00000540447 6393 ntTSL 28.68□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 BCKDK-208ENST00000567530 1796 ntTSL 518.61■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 BCKDK-207ENST00000566568 2558 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 BCKDK-205ENST00000484226 754 ntTSL 312.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 36.3
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SF3B4Q15427 HEMK1-204ENST00000443894 634 ntTSL 314.15□□□□□ -0.144e-9■■■■■ 36.3
SF3B4Q15427 HEMK1-207ENST00000482974 3265 ntTSL 210.52□□□□□ -0.734e-9■■■■■ 36.3
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SF3B4Q15427 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.082e-9■■■■■ 36.3
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SF3B4Q15427 EML3-204ENST00000419857 578 ntTSL 417.94■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 36.2
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SF3B4Q15427 EML3-210ENST00000466886 599 ntTSL 412.45□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 36.2
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SF3B4Q15427 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 320.84■□□□□ 0.931e-9■■■■■ 36.2
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SF3B4Q15427 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 317.56■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 36.2
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SF3B4Q15427 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 315□□□□□ -0.011e-9■■■■■ 36.2
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SF3B4Q15427 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 212.5□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 312.28□□□□□ -0.441e-9■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 312.28□□□□□ -0.441e-9■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 511.57□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 38.17□□□□□ -1.11e-9■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 MARS-224ENST00000551805 479 ntTSL 24.59□□□□□ -1.673e-8■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 TRABD-205ENST00000463233 2404 ntTSL 1 (best)18.39■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 UBXN8-203ENST00000380154 1624 ntTSL 211.41□□□□□ -0.583e-13■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 UBXN8-209ENST00000620074 1058 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.83e-13■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 UBXN8-205ENST00000522968 813 ntTSL 310.02□□□□□ -0.813e-13■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 UBXN8-202ENST00000341403 1202 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.93e-13■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 UBXN8-207ENST00000615729 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.933e-13■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.253e-13■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 FLCN-205ENST00000417064 757 ntTSL 219.01■□□□□ 0.638e-11■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.438e-11■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 FLCN-209ENST00000480316 786 ntTSL 210.54□□□□□ -0.728e-11■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 ZGPAT-205ENST00000431125 427 ntTSL 217.09■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 SLC38A3-202ENST00000417851 438 ntTSL 311.87□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 RNF44-207ENST00000513029 1647 ntTSL 216.05■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 CTSA-211ENST00000606066 603 ntTSL 512.93□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 36.2
SF3B4Q15427 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 36.2
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