Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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PTPRRQ15256 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTPRRQ15256 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTPRRQ15256 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTPRRQ15256 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTPRRQ15256 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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