Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KARSQ15046 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KARSQ15046 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KARSQ15046 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KARSQ15046 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KARSQ15046 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KARSQ15046 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KARSQ15046 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KARSQ15046 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KARSQ15046 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KARSQ15046 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KARSQ15046 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
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