Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE7AQ13946 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE7AQ13946 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms