Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4AQ13619 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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